古内丹家认为人的精气神是一个整体，三者相互联系，又相互作用。这是内丹理沦的基础与核心内容。早在《淮南子》与《太平经》中就有相关论述。
《淮南子·原道训》说：形是生命的居所，气充斥生命体中，神为生命的控制者。三者应当各司其职．各当其位，一方面不好，则影响另外两个方面。《太平经》说：精气神是一个整体，来自于天地人之气。神源自天，精源自地，气来自中和。神与气结合在人体内运动，三者相辅相成。若想长寿，必须爱护、保养精气神。而清代丹书《抱混元仙术》讲得更为清楚：精气神，名称虽然是三个，实际是一个整体，一是混元的意思，三是分开来说。一是体，三是用。所以混元之体，纯一不杂为精，融通血脉为气，虚灵活动为神。它们之间，一个动则牵动另外两个．所渭“神一凝而气自壮，神一清而精自勇”、“神聚则气聚，气聚则精聚；神清则气清，气清则精清”。
传统内丹功法着眼于炼精化气，炼气化神的过程，认为精可以化为气，气可以化为神，但是传统的精气神理论并没有把元神元气元精的关系讲得清晰明白，理沦上尚欠完善。以此指导炼功，必然影响功法的实施，使功法局限性大，又不好把握，不好认识。例如，古代功法大多炼自身精、气、神，少知修炼混元祖气；把周天功当作惟一有效的内丹功法；有的功法排斥意念作用；把人性与天性等同而不加区别，不知人性的特殊性；把性与命对立起来．以致在先性后命，还是先命后性上争论不休；否定禅宗明心见性的其实性，有效性等等。所以，传统内丹理论和功法必须变革，才有生命力，才能发展、提高．才能为更广大的人民群众学习、掌握，为现代社会人类的生活做出更大的贡献。
